曲阜是24个历史文化名城之一，是黄帝生地、神农故都、少昊之墟、商奄故国、周汉鲁都、孔子故里，文化底蕴深厚，文物古迹众多。以世界文化遗产“三孔”为代表的曲阜古建筑遗存，既是北方官式建筑的代表，又有自己独特的地域性，历史文化内涵非常丰富，具有很高的学术研究价值，是全面系统研究明清官式建筑营造技艺的理想之地。

2014年4月曲阜启动了“三孔古建筑彩画保护工程”。2015年7月，“明清官式建筑保护研究国家文物局重点科研基地曲阜分基地”和“山东省文物局文物保护科学与技术研究重点基地”在曲阜挂牌成立。两大文物科研基地的目标，是以“三孔”明清官式古建筑群为平台，系统研究传统建筑材料、技艺、形制等学术空白，建设明清官式古建筑学术研究高地。科研基地的建设及日常运营由曲阜三孔古建筑工程管理处具体承担。